Il museo fu fondato nel 1807 ed ha sede nella Long Gallery della casa massonica principale di Edimburgo. Il museo accogli una nutrita collezione che comprende Gioielli, mobili, ceramiche, strumenti di loggia, vetri lavorati e incisi, nonché dipinti e fotografie.
Al suo interno vengono organizzate periodicamente delle esposizioni temporanee, mentre ve ne sono permanenti che rendono fruibili al pubblico alcuni paramenti e oggetti massonici appartenuti a massoni famosi, di particolare rilevanza alcuni oggetti appartenuti al poeta Robert Burns (1759-1796).
Adiacente al museo è collocata la biblioteca, che accoglie libri e manoscritti relativi alla storia della massoneria in Scozia. Oltre i volumi vi sono anche alcuni importanti e antichi documenti: first e Secon Schaw Statutes che risalgono al 1598 e al 1599; le St. Claire Charters del 1601 e del 1628, tutti documenti storici imprescindibili per la storia della massoneria.
Il museo e la biblioteca sono aperti al pubblico.
